イネ縞葉枯病抵抗性品種「St. No. 1」におけるStvb-i領域のゲノム構造

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要約

イネ縞葉枯病抵抗性品種「St. No. 1」の抵抗性遺伝子Stvb-i 領域には、感受性日本型イネ品種「日本晴」に比べ、約10kbのトランスポゾンの挿入と6.5kbから10kbへの置換がある。

  • キーワード:イネ、縞葉枯病、抵抗性遺伝子、ゲノム構造
  • 担当:北海道農研・生産環境部・ウイルス病研究室
  • 連絡先:電話011-87-9278、電子メールhsyuriko@affrc.go.jp
  • 区分:北海道農業・生産環境
  • 分類:科学・参考

背景・ねらい

インド型イネ品種「Modan」に由来するイネ縞葉枯病抵抗性遺伝子Stvb-i は、感受性日本型イネ品種に導入されて30年以上の安定した抵抗性を発現している。その高度に安定した抵抗性機構の解明を目指してStvb-i 遺伝子の単離およびその効率的な遺伝子の利用に資するために、抵抗性品種「St. No. 1」における本遺伝子領域のゲノム構造を明らかにする。

成果の内容・特徴

  • インド型イネ品種「Modan」に由来するイネ縞葉枯病抵抗性遺伝子Stvb-i は、イネ第11染色体長腕動原体近傍に座乗し、DNAマーカーG220-G257間にあって、感受性日本型イネ品種「日本晴」における遺伝子領域は約30kbと算出される(図1-A)。
  • 「Modan」に由来する抵抗性品種「St. No. 1」における遺伝子領域は約44kbと算出される(図1-B)。
  • 日本晴」の塩基配列と比較した場合、「St. No. 1」においてはCACTA型トランスポゾン10.9kbの挿入がある。(図-B)。
  • トランスポゾンの挿入位置に続く動原体側約10.1kb断片は、「日本晴」の6.5kb断片と置換している(図-B)。
  • その他にも数塩基単位の変異(置換・挿入・欠失)が点在する(図-B)。
  • 当領域には8つの遺伝子が予測される(図-C)。
  • イネ縞葉枯病抵抗性選抜マーカーST10は、当該遺伝子領域内のトランスポゾンに近接している。

成果の活用面・留意点

  • 予測される8つの遺伝子の機能については詳細な検討が必要。
  • 「Modan」に由来する抵抗性系統の選抜においてST10の選抜効率はほぼ100%である。

具体的データ

図.イネ縞葉枯病抵抗性遺伝子Stvb-i領域のゲノム構造

その他

  • 研究課題名:イネ縞葉枯病抵抗性遺伝子の単離
  • 課題ID:04-06-01-*-08-03
  • 予算区分:委託プロ(ミュータントパネル)
  • 研究期間:2001～2003年度
  • 研究担当者:早野由里子、齋藤浩二、杉浦直樹(愛知農総試)、井澤敏彦(愛知農総試)、眞岡哲夫、福本文良
  • 発表論文等:1) 早野由里子(2002) 北海道農業研究センター報告 175:1-45.
                      2) 早野由里子他(2002) 育種学研究 4(別2):107