イネいもち病抵抗性遺伝子と連鎖する分子マーカー

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要約

イネいもち病抵抗性遺伝子(Pii、Pik-m、Pit)と分子マーカーの間で連鎖分析を行い、各いもち病抵抗性遺伝子と連鎖する分子マーカーを見出した。

いもち病抵抗性遺伝子(Pii、Pik-m、Pit)とRFLPマーカー等の分子マーカーとの連鎖関係を明らかにし、分子マーカーを慣行育種における抵抗性品種育成のマーカーとして利用するとともに、抵抗性遺伝子クローニングの素材を提供する。

コシヒカリ/石狩白毛のF₃系統を用いてPiiと連鎖するDNA断片を増幅するPCRプライマーを探索し、プライマ-CA05を見出した。Piiはプライマ-CA05を用いたPCR反応によって増幅するDNA断片の有無と5.9cMの遺伝距離で連鎖する。このDNA断片はPiiを持つ品種、「石狩白毛」、「キヌヒカリ」、「ヒノヒカリ」のいずれにおいても増幅する(図1)。
コシヒカリ/ツユアケのF₃系統を用いてRFLPマーカーとPik-mの連鎖分析を行った結果、Pik-mは第11染色体上に座乗することが明らかになった。Pik-mはRFLPマーカ-R1506と密接に連鎖する(0.0cM)。
コシヒカリ/K59(Pitの代表品種)のF₃系統を用いて、RFLPマーカーとPitの連鎖分析を行った結果、Pitは第1染色体上に座乗することが明らかになった。PitはCA59プライマーを用いたPCR反応によって増幅するDNA断片の有無と密接に連鎖する(0.0cM、図2)。

図1 CA05プライマーによって増幅するPiiを持つ品種に特異的なDNA断片(矢印)

図2 CA59プライマーによって増幅するPitと連鎖するDNA断片(矢印)