九州で分離されたトマト黄化えそウイルスのNタンパク質のアミノ酸配列の比較

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要約

九州7県で最近発生したトマト黄化えそウイルスの外被タンパク質に相当するNタンパク質遺伝子の塩基配列を決定して相互に比較すると、原寄主及び発生県によりアミノ酸配列の一部が異なっている。

近年、九州地方でトマト黄化えそウイルス(TSWV)による病害がキクおよびピーマンを中心に発生している。RT-PCRによる被害株からの病原ウイルスの検出法を確立するとともに、Nタンパク質のアミノ酸配列を決定し、分離株相互で比較することで遺伝的特性を解析する。

既報TSWVのSRNAの塩基配列より作製した共通プライマーを用いるRT-PCR法(図1)により、黄化えそ症状を示していた熊本県・宮崎県・鹿児島県・佐賀県・長崎県のキク、大分県のピーマンまたは福岡県のパプリカから発生作物に関わらず検出できる。
RT-PCR増幅産物の塩基配列から推定されるNタンパク質のアミノ酸配列は全ての株において互いに高い相同性を示す(図2)。すなわちキク、ピーマンおよびパプリカで発生作物による大きな差異は見つからない。
分離した株間のアミノ酸配列の相違部分を利用することで、これらの株を遺伝子診断により識別できる。

図1 RT-PCRに使用したプライマーおよび反応条件

図2 九州地域で発生したTSWVのNタンパク質のアミノ酸配列の比較