シバ遺伝資源における遺伝的類縁関係

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要約

15種類のSSRマーカーを用いて、わが国在来のシバ属6種48品種・系統の多型解析を行った。多型情報にもとづく類縁関係から、供試48品種・系統は大きく10群に分類できる。

シバの育種を効率よく進めるためには、幅広い変異を示す多数の遺伝資源を収集・導入することが重要である。そこで、本研究ではシバ品種「朝駆」由来のSSRマーカーを利用して、沖縄を中心に収集したシバ属の多型解析を行い、それらの遺伝的類縁関係を明らかにする。

シバ属6種48品種・系統のゲノミックDNAを鋳型に、15種類のSSRマーカーを用いて多型解析を行った。その結果、全てのSSRマーカーにおいて、品種・系統あたり1-2本の明瞭な増幅断片が得られた。
検出された多型情報をもとに各品種・系統間の近縁度を算出し、UPGMA法によりクラスター分析を行った。得られた類縁関係から供試48系統は大きく10群に分類することができ、各分類群は形態的特徴にもとづく種の分類結果と概ね一致する。
シバ(Z. japonica)、コウライシバ(Z. tenuifolia)、コオニシバ(Z.
sinica)およびオニシバ(Z. macrostachya)系統では収集地の近い系統でクラスターを作る傾向が認められるが、コウシュンシバ(Z.
matrella)には各クラスターを構成する系統間の関係にそのような地理的分布は見いだせなかった。
わずかな形態形質の違いを指標として分類されるシバ属において、SSRマーカーによる分類は種を同定する際の目安として利用できる。

図1 収集地点図2 各品種・系統間の近縁度にもとづく供試48系統間の類縁関係