プレスリリース
(研究成果)NARO(ナロ)ジーンバンクとナショナルバイオリソース プロジェクトのデータ連携による 遺伝資源の横断検索システム(PGR-Gateway)

開発の社会的背景と研究の経緯

遺伝資源は、農産物や医薬品などとして活用する直接的な価値と、地球環境保護に利用する間接的な価値を持ち、将来の人類にとって貴重な財産です。いくつかの国立研究開発法人や公設試験場、大学等では遺伝資源を収集・保存し、配布や情報提供を行っています。遺伝資源の利用者にとって、どこの保存機関がどのような遺伝資源を保存しているかという情報は重要であり、効率的に遺伝資源を探すことができる環境の整備が求められています。NAROジーンバンクではNARO遺伝資源データベース(NAROGBdb)、NBRPではOryzabase(イネ、代表機関:国立遺伝学研究所)やKOMUGI(コムギ、代表機関:京都大学)等のデータベースが整理され、利用者はそれぞれのデータベースを使って目的の遺伝資源を検索しています。しかし、各データベースで検索方法や表示方法などが異なっており、利用者は同じ検索を何度も繰り返す必要があります。遺伝資源の利用者が効率的に見落としなく必要な遺伝資源を検索するためには、関連するすべてのデータベースを横断的に検索できることが理想的です。
そこで、今回の研究では、国立研究開発法人や公設試験場、大学等が保有する植物遺伝資源情報を横断的に検索できるシステムを開発することを最終的な目的として、国内の代表的植物遺伝資源保存事業であるNAROジーンバンクとNBRPの横断検索を可能とするシステムの開発に取り組みました。NAROジーンバンクは農学研究の立場から将来の品種改良の素材に利用できる国内外の在来品種や育成品種を中心に保存しているのに対して、NBRPは国立遺伝学研究所等が主体となってライフサイエンス研究の立場から野生種や実験系統も含めた幅広い遺伝資源を保存しています。横断検索システムの第一弾として、NAROジーンバンクで最も保存点数が多く利用者も多いイネとコムギに関して、NAROジーンバンクとNBRPとのデータを横断的に検索できるPGR-Gatewayを開発し、公開しました。両者の遺伝資源の横断検索が可能になることで、利用者の検索のワンストップ化を実現し、利便性の向上が期待できます。

研究の内容・意義

今後の予定・期待

PGR-Gatewayによって、各利用者がNAROジーンバンクとNBRPの保存するイネとコムギ遺伝資源をワンストップで効率的に検索することが可能になります。検索結果から、NAROジーンバンクもしくはNBRPのWebサイトに進み、それぞれの保有する遺伝資源の配布手続きを行うことができます。現在は、原産地情報など植物遺伝資源導入の際に付加されている来歴データのみが検索対象です。特性による検索に関しては、今後の追加を検討しています。また、PGR-Gatewayでは、参加登録機関や対象作物を追加・拡張していくことが可能です。今後は、都道府県との連携も進めていきます。

用語の解説

参考図