倒伏樹の立て直しと植え替えの判断は、明確な基準がなく困難である。今回(1991年)の台風では南風のため、北を枕に倒れた樹がほとんどである。その場合、北側半分の根系は南側に比べ被害が少ないと考えられる。しかし、1991年の台風による根の被害状況を調査した結果では、わい性台の倒伏樹の場合、倒伏せずに若干傾いた樹では風上の根は30%程度が断根し、反対側も10%弱の断根がみられている。また、45度程度傾いた樹および横倒しになった樹は、風上では30%、反対側でも20%程度の折れや断根がみられている。断根の程度は、台木、樹齢、土壌の種類、土の硬さなどで異なる。
完全に倒伏した樹齢20～30年の成木の立て直しは難しいと判断されるが、20年生以下の場合には立て直しでかなり回復させることができる。ただし、その場合も倒伏後の立て直しまでの時間が問題となる。10月中は、まだ樹の発根力があり、9月末の台風被害直後に立て直した場合には、年内にかなりの発根があるとされ、11月以後に立て直した 樹での発根は、翌春までみられない例が多かった。
わい性台リンゴ樹の経済寿命は、栽培条件によって同じではないが、20年前後と考えられる。経済寿命があと5、6年と考えられる老木が倒れた場合には、植え替えを考える。その場合、2、3年生苗が手に入ればそれを利用する。また、一旦、立て直したあとに周囲に苗を植えて、しだいに更新するのもよい。なお、樹列の一部だけを改植するときには、以前と異なった品種を植えると、作業に種々な困難が生じる。わい性台リンゴ園では、同じ列には同じ品種を植えることが省力化の原則である。別の品種を植えるときには、列ごとの更新を考える。
普通台リンゴ樹では、20年生より若い場合には、落果しなかった果実の成熟を待ち、収穫が終ってから立て直す。しかし、倒伏した樹の多くは、紋羽病(白、紫)や高接ぎ病におかされているものが多く、これらは更新の対象になる。また、老木樹が倒れた場合も更新することが多い。このような場合には、改植障害に備え、土壌消毒を行ったうえで、堆肥を多めに施してから若木を植え付ける。